合同专用条款是招标投标的重要内容。施工招标文件中载明的合同主要条件是双方签合同的依据，一般不允许更改。招标文件中的合同条款是招标人单方面订立的，强迫投标人同意了，才能参加投标，即由要约人（投标人或合同中的承包人）向受要约人（招标人或合同中的发包人）发出要约，而一旦选定中标人，招标文件里的合同条件就成为受要约人的“承诺”，具有了法律约束力。
工程施工招标不像其他项目招标，它在招标文件中由招标人制定和载明的合同专用条件，常规上一般不允许偏差，如果投标人在投标时不同意合同条款，中标的可能性基本为零（中标后合同签订时的变更除外）。合同条件中比较重要的内容有：1.合同文件及解释顺序编制招标文件合同部分时，一般都会比较注意通用条款、专用条款、协议书、保修书、安全承诺、履约保函等合同文件，而往往忽视了构成合同文件的其他内容，从而忽略了其合同文件的解释优先顺序，直至真的发生合同争议，才发现解释顺序很重要。《标准文件》在通用合同总则中将优先顺序载明了，也是不能更改的。2.发包人和承包人的义务发包人和承包人的义务：发包人和承包人还应在专用合同条件中详细规定双方义务。例如：施工前的现场条件中应由发包人承担的部分：水、电接口；道路开通时间；地下管线资料；水准点与座标控制点交验等。承包人承担的部分：钻空和勘探性开挖；邻近建筑物、构筑物、文物安全保护；交通、环卫、噪音的管理；转包和分包的情况；材料的保管使用；完工清理等。还有双方共同承担的内容：双方风险损失；保险；专利；临时设施等。应按照国家相关要求和建筑行业的行规认真编制。价款是否调整？如何调整？应在合同中说明；
工程预付款的支付方式、数额（一般按工程合同总价款的比例）、抵扣方式；
按进度支付时的工程量确认；
支付进度款的时间和所占比例；
保修金的比例和支付时间、方式；其他应在专用合同条件中确定的条件。
此外，合同专用条款还有设计变更的特殊约定、保函的提交时间和额度、保险、争议解决方式、验收和结算、安全施工、质量保证、环保节能、施工组织设计、图纸等等。
